生物系の研究では基本のキ、のウェブサイト
NCBI (National Center of Biotechnology Information, 言わずと知れたNCBI。BLASTやゲノム配列検索など)
Pubmed（文献検索サイト。My NCBIに登録することで論文アラートも届けてくれる。）
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/
GoogleScholar（Pubmedでは拾ってこれないような論文もよくある。）
https://scholar.google.co.jp/schhp?hl=ja
論文ウォッチ（日本語で最新の生物系論文情報がまとめられている。医学系多め。）
NEBcloner（制限酵素を２種類使うときに使用。）
https://nebcloner.neb.com/#!/redigest
Cold Spring Harbor Protocol（基礎的な実験条件や試薬レシピについて調べる時便利。）
Labome（実験プロトコルについてはこちらも参照したり。）
https://www.labome.com/method/index.html
植物の研究を進める上で有用なウェブサイトやウェブツール
TAIR (シロイヌナズナのデータベース)
ATTED-II（植物の共発現データベース）
travaDB (シロイヌナズナの発現データベース、RNAseq)
http://travadb.org/how_to_use/
RikenBRCー実験植物開発室データベース
https://epd.brc.riken.jp/ja/resource/catalog_plantc
RAP-DB (イネのデータベース。RiceXproなどへのリンクもあり。)
TIGR (Rice Genome Annotation Project):
http://rice.plantbiology.msu.edu/index.shtml
RiceXpro (日本晴(japonica)のいろいろな時期、器官における遺伝子発現データベース)
http://ricexpro.dna.affrc.go.jp
RED (Rice Expression Database; RiceXproはマイクロアレイのデータだがこちらはRNAseqデータ）
Oryzabase（遺伝研が作っている野生イネに関するデータベース）
https://shigen.nig.ac.jp/rice/oryzabase/
Oryza longistaminata information Resource
RiceVarMap2（イネSNPデータベース）
http://ricevarmap.ncpgr.cn/v2/
OryzaGenome (O. sativa, O. rufipogon, O. longistaminataのSNPの比較ができる（可視化された状態で）)
http://viewer.shigen.info/oryzagenome2/mapview/MapView.do?action=ini&chromosomeNo=1
Rice SNP-seek database（イネ3000種のゲノムデータからSNP情報を抽出してまとめたデータベース）
https://snp-seek.irri.org/index.zul
RiceGE: Rice Functional Genomic Express Database (TAIRにあるイネの発現データベース。)
http://signal.salk.edu/cgi-bin/RiceGE7
Gramene（イネ、トウモロコシ、コムギなど穀物grainに関するデータベース。ゲノム、QTL、マーカー情報など）
Gramene marker homepage（RMマーカーの位置や配列を検索できる）
https://archive.gramene.org/markers/
STRING (相互作用相手を予想できる、sativaだけでなく野生種の情報もある）：
https://string-db.org/cgi/input.pl?sessionId=NWirIvAXQQEX&input_page_show_search=on
BioGRID（相互作用検索データベース）
AtCAST（相互作用検索データベース）
http://atpbsmd.yokohama-cu.ac.jp/cgi/network/home.cgi
PANTHER (オルソログ探しに最適)
UniProt (タンパク質のドメイン探しやその他役立つ情報など)
Plant Omics Data Center
http://plantomics.mind.meiji.ac.jp/podc/index.html
SignalP (シグナル配列の有無、cleavageサイトの有無、cell localizationなど)
http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP-4.1/
NetPhos 3.1 Server（リン酸化サイト予測サイト）
http://www.cbs.dtu.dk/services/NetPhos-3.1/
P3DB（Plant specificなリン酸化予測サイトはこっちかな）
http://www.p3db.org/search.php
SALAD database (系統関係の理解に役立つ)
https://salad.dna.affrc.go.jp/salad/
陸上植物の進化（基礎生物学研究所長谷部研究室による植物の分類系統）
http://www.nibb.ac.jp/evodevo/tree/00_index.html
研究を進める上で有用なウェブサイトやウェブツール
共通 / 非共通の遺伝子リストなどをベン図やヒートマップで視覚化する intervene
http://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/02/03/073000
データを可視化するwebツール PlotsOfData
http://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/04/02/073000
https://huygens.science.uva.nl/PlotsOfData/
植物ゲノムアノテーションサービスMEGANTE
http://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2019/03/20/073000
https://megante.dna.affrc.go.jp
PGDD（様々な遺伝子のシンテニー関係検索）
http://chibba.agtec.uga.edu/duplication/
Phytozome (植物の比較ゲノムに使える)
https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
QuickGO (様々な生物のGO)
https://www.ebi.ac.uk/QuickGO/
AgriGO v2.0 (様々な生物のGO、植物関係の人はこれ使ってるのをよく見る気がする)
http://systemsbiology.cau.edu.cn/agriGOv2/
ReviGO（GOの可視化に使える）