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6. リードカウントのクオリティチェック(PCA, clustering)

2021.06.10 初稿

 

Rコマンドを見る必要あり。

 

iDEPというサイト(http://bioinformatics.sdstate.edu/idep/)ではリードカウントのcsvファイルをアップロードすることで、PCAやクラスタリング、DEG解析まで行ってくれてFigureもとても綺麗。一旦自分のデータがどうなっているか可視化するのに使うのにおすすめです。

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