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Research Memo
Useful website/tools
RNA-seq analysis
0. CUIで解析をする際に重要なこと
1. 解析環境の構築、フローの把握
2. シークエンスデータのQC・トリミング
3-1. TRINITYを用いたde novoアセンブル
3-2. HISAT2を用いたマッピング
4. リード数カウント
5. リードカウントのマトリクスを作成する
6. リードカウントのクオリティチェック（PCA, clustering）
7. フィルタリング
8. 翻訳とblastとアノテーション
9. DEG (発現変動遺伝子) 解析
10. GO解析
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iNaturalist x Gall論文が公開になりました
Kanako
2025年9月30日
読了時間: 5分
アメリカネナシカズラの虫こぶは花を作る遺伝子群が働くことによってできる
Kanako
2025年9月29日
読了時間: 4分
最近寄稿した文章
Kanako
2024年3月28日
読了時間: 1分
博士課程を知る。
Kanako
2022年7月30日
読了時間: 1分
2010年代に入ってのイネゲノム研究
Kanako
2021年8月11日
読了時間: 7分
産後休の過ごし方
Kanako
2021年4月30日
読了時間: 3分
UJAへの記事の寄稿
Kanako
2020年12月4日
読了時間: 1分
TurboIDを用いたproximity-labeling
Kanako
2020年3月10日
読了時間: 5分
9月の一時帰国やりきりました。
Kanako
2019年9月22日
読了時間: 4分
Are plants boring?
Kanako
2019年9月2日
読了時間: 5分
2019年JPR論文賞受賞
Kanako
2019年5月31日
読了時間: 4分
アメリカに来て気づいたこと（研究・研究関連編）
Kanako
2018年10月6日
読了時間: 4分
笑いとプレゼン
Kanako
2018年9月27日
読了時間: 6分
学振PD申請とその結果
Kanako
2018年1月31日
読了時間: 6分
学振採択および受賞等に必要な３ヶ条
Kanako
2017年10月28日
読了時間: 5分
取材をうけて改めてキャリアについて考えた
Kanako
2017年8月30日
読了時間: 4分
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